Södra Gunsta ligger ungefär 14 kilometer öster om Uppsala centrum intill länsväg 282. Området består idag av ett kuperat område med skog och mindre våtmarker, samt ett låglänt öppet landskap.

I närheten finns stora friluftsmarker som till exempel Fjällnoraområdet, sjön Trehörningen, och Vedyxaskogen. Upplandsleden och en Linnéstig ligger också nära. Dessa är värdefulla för både boende i planområdet och för Uppsalaborna i stort.